Iniciou a prática do futebol no Real Massamá, onde foi colega de Nani, deu nas vistas e foi contratado pelo Sporting. Era médio, mas nos juvenis começou a jogar como defesa lateral direito, como conta na extensa entrevista à ACADEMIA DE TALENTOS.

Cedido pelo Sporting, cedo ganhou o lugar na equipa treinada pró Jorge Costa que conseguiria o histórico regresso ao escalão principal 34 anos depois, sendo um dos grandes destaques da equipa. Habitualmente convocado para as selecções jovens, ao serviço do nosso clube também o foi, mantendo a titularidade no seu posto na categoria de sub-21.

A poucas jornadas do final lesionou-se gravemente num jogo em Olhão frente ao Freamunde, a poucas jornadas do final. Mas isso não o impediu de ir a Gondomar, de muletas, para presenciar a vitória que garantiu a subida, nem de marcar presença no último jogo no José Arcanjo, o da consagração e da entrega da taça de campeão da Liga Vitalis. Abaixo está uma sequência de imagens desses momentos.

A temporada 2009/10 começou-a em recuperação, perdendo grande parte da primeira "volta" por isso. Alinhou, no entanto, em 10 partidas, antes de voltar a sofrer problemas físicos. Foi apenas no segundo ano no escalão principal que João Gonçalves voltou a exibir-se ao seu melhor nível, tendo oportunidade de regressar ao Sporting, onde efectuou a pré-época, mas acabou por ser cedido novamente, escolhendo continuar em Olhão.

Em 2011/12, pelo quarto ano consecutivo, actuou no nosso clube por empréstimo, lesionando-se a meio da temporada novamente. No ano seguinte fez a pré-temporada com a equipa B do Sporting, onde chegou a alinhar em alguns jogos, sendo depois cedido ao Vitória de Guimarães.





João Gonçalves "viveu" a subida de forma muito especial, após a grave lesão